Numerosas especies protistas se comparten entre humanos y cerdos. Entre ellos, Giardia duodenalis, Cryptosporidium spp. y Balantioides coli tienen una clara importancia para la salud pública y animal. Para otros como Enterocytozoon bieneusi y Blastocystis spp., su impacto en la salud animal no se ha establecido completamente.

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