El Mar Menor ha sufrido en los últimos años varios episodios de falta de oxígeno, lo que se conoce como anoxia. Esto ha generado un debate nacional e internacional sobre cuáles son los motivos de su degradación y contaminación. Informes realizados por diferentes organismos científicos certifican que el fósforo que contienen las aguas residuales es el principal limitante de la aparición de vegetales marinos.

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